Muzejski oddelek Slovenske kinoteke ima svoje korenine v Filmskem muzeju, ki ga je leta 1973 ustanovilo Dru�tvo slovenskih filmskih delavcev kot stalno kulturno akcijo. Leta 1976 so bile postavljene osnovne smernice zbiralne politike muzeja � sistematično zbiranje eksponatov, pomembnih za zgodovino slovenskega filma, in dokumentiranje slovenske filmske proizvodnje. 1. februarja 1979 se je Filmski muzej priključil Slovenskemu gledali�kemu muzeju, ki se je preimenoval v Slovenski gledali�ki in filmski muzej.

Z ustanovitvijo Slovenske kinoteke je Filmski muzej postal integralni del nove ustanove in v kinotečni okvir so bile prenesene tudi vse zbirke. V svoji tridesetletni zgodovini je filmski muzej razvil tudi razstavno dejavnost, njegova podatkovna baza pa je bila osnova za izdajanje publikacij o slovenskem filmu. Danes muzejski oddelek Slovenske kinoteke nadaljuje delo filmskega muzeja, vendar se je področje delovanja raz�irilo; prevzel je skrb za zbiranje, ovrednotenje muzealij, pomembnih za zgodovino filma in kinematografije na Slovenskem.